Podle Světové zdravotnické organizace (WHO) v současnosti žije s infekcí HIV asi 33 milionů lidí.
Jakmile vstoupí virus HIV do lidské buňky, přinutí ji pomocí bílkovin (enzymů) vytvářet jeho vlastní kopie. Kopie viru potom infikují další buňky.
Většina léků proti HIV funguje tak, že blokují jeden nebo více těchto enzymů. Současný výzkum vědců ústavu Scripps je zaměřen na vývoj nových sloučenin, jež by stabilizovaly tvar enzymu HIV proteáza, a tím pomohly zastavit replikaci viru.
Protože HIV podléhá velmi častým mutacím, některé léky zaměřené na blokaci replikace enzymu již nefungují nebo nefungují dostatečně účinně. Tým renomovaného ústavu Scripps Research Institute se snaží pomocí výpočtů realizovaných v rámci projektu World Community Grid FightAIDS@Home vyvinout nové léky, jež by se vázaly na více míst mutovaného enzymu, a tím by jej blokovaly efektivněji.
Díky 1,5 milionu počítačů připojených k síti IBM World Community Grid jsou nová vazebná místa na HIV proteáze podrobována virtuálním screeningovým experimentům.
World Community Grid sdružuje nevyužitý výpočetní výkon osobních počítačů dobrovolníků z více než 80 zemí světa. Je v současnosti největší veřejnou humanitární sítí na světě, jejíž výkon je ekvivalentní 15. nejvýkonnějšímu superpočítači světa.
Za pouhých pět let poskytl projektu výzkumného ústavu Scripps více než 107 000 let výpočetního času a zpracoval na 104 miliony výpočtů.
Profesor C. David Stout, hlavní autor studie, uvedl: „Tyto výsledky otevírají dveře zcela novému přístupu při vývoji léků proti HIV proteáze,“ enzymu, s jehož pomocí vytváří virus HIV nové, infekční virové částice.
Na zmíněném výzkumu se podíleli dva členové týmu FightAIDS@Home, výzkumný pracovník Alex L. Perryman, Ph.D. a profesor Arthur J. Olson, kteří nyní pracují na dalším rozšíření výzkumu. Tento objev bude základem vývoje nových léků v boji s rostoucím počtem rezistentních kmenů HIV a zlepšení účinnosti současné léčby. Výsledky se tak stávají východiskem pro vývoj nové generace účinnějších léků na HIV/AIDS.
Ve druhé studii nedávno publikované v časopisu Journal of Molecular Biology použil tým Scripps počítačové modelování k lepšímu pochopení mechanismu působení dalšího HIV enzymu (významného terapeutického cíle) – integrázy. Integráza, vedle proteázy a třetího enzymu - reverzní transkriptázy, je jedním z klíčových proteinů, které umožňují viru HIV převzít buněčné děje hostitelské buňky a replikovat sebe sama. Vytvoření přesnějšího modelu integrázy umožňuje hledat nové molekuly léčiv, které budou inhibovat i mutantní formy tohoto enzymu rezistentní vůči stávajícím lékům. Na výzkum nového léku proti HIV integráze byl týmu Scripps nedávno udělen vládní grant v rámci zákona American Recovery and Reinvestment Act.
Chcete-li věnovat i vy nevyužitý výpočetní čas svého počítače na humanitární výzkum v různých oblastech včetně léčby rakoviny, vývoje výživnější rýže, nebo zajištění efektivnějších zdrojů energie, navštivte prosím: www.worldcommunitygrid.org.
Facebook komentáře